概述
本报告评估了欧盟/欧洲经济区 (EU/EEA) 实验室在肺炎链球菌检测和表征方面的能力,包括非培养和培养方法。评估包括一个共享的非培养面板和两个肺炎链球菌培养分离物。总体而言,实验室在基于培养物的物种鉴定方面表现强劲,在培养物血清分型方面也表现出较高的一致性。然而,非培养病原体检测正确,但非培养材料血清型报告的完整性较低,这表明需要改进非培养血清型报告的完整性和一致性。
关键数据和结果
- 参与情况:共有来自 24 个国家的 34 个 EU/EEA 实验室参与了评估。所有实验室都收到了非培养面板,其中 32 个实验室提交了至少一个非培养样本结果。24 个实验室请求了肺炎链球菌培养面板,其中 23 个实验室提供了可分析的分离物结果。
- 非培养样本:对于预期的含有肺炎链球菌血清型 14 的 NC3 样本,28/31 (90.3%) 的实验室正确鉴定了病原体。对于预期的含有肺炎链球菌血清型 23F 的 NC5 样本,同样有 28/31 (90.3%) 的实验室正确鉴定了病原体。然而,对于可解释的病原体反应实验室,正确的血清型分配仅为 7/31 (22.6%) 对于 NC3 和 6/31 (19.4%) 对于 NC5。
- 培养分离物:对于两种培养分离物 P1 和 P2,所有 23 个实验室都正确鉴定了肺炎链球菌物种。对于 P1,19/23 (82.6%) 的实验室正确报告了血清型 23F,对于 P2,21/23 (91.3%) 的实验室正确报告了血清型 14。当仅限于报告可解释血清型结果的实验室时,一致性为 P1 的 19/21 (90.5%) 和 P2 的 21/21 (100.0%)。
- 抗菌药物敏感性试验 (AST):对于两种培养分离物,AST 的采用率都很高。21/23 (91.3%) 的实验室为 P1 报告了 MIC 测试,20/23 (87.0%) 的实验室为 P2 报告了 MIC 测试。对于大多数抗生素,MIC 一致性在苯唑西林和头孢他啶中最高。
- 全基因组测序 (WGS):11/23 (47.8%) 的实验室对每个肺炎链球菌分离物进行了 WGS。在 WGS 阳性提交中,序列类型报告完整,而 LINcode 报告较少完整。
研究结论
本评估表明,参与 IBDLabNet 的 EU/EEA 实验室在基于培养物的物种鉴定方面具有强大的能力,并且在培养物血清分型方面通常表现出良好的能力。主要的剩余差距在于非培养材料的血清型报告的完整性和一致性。需要采取措施来改进非培养血清型报告,包括有针对性的技术指导或培训,以及加强血清型报告的标准化。
建议
- 优先考虑改进非培养肺炎链球菌血清型分析。
- 在未来的 EQA 轮次中收集更结构化的方法信息。
- 加强肺炎链球菌血清型报告的标准化。
- 保持标准化的 AST 报告。
- 进一步规范 WGS 衍生报告。
- 增加未来肺炎链球菌面板的教育价值。
- 使用 EQA 结果进行有针对性的反馈和培训规划。