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第十次欧盟/欧洲经济区及欧盟扩大国家利斯特氏单核细胞增生李斯特菌分型外部质量评估方案，2023

2025-03-28 - 欧洲疾病预防控制中心 Bach🐮

欧洲疾病预防控制中心监测第十次李斯特菌单核细胞增生型外部质量评估方案

核心观点

评估目标：该方案旨在评估欧盟/欧洲经济区国家及候选国家中，国家级公共卫生参考实验室（NPHRLs）报告的基因分型数据的质量和可比性，以支持李斯特菌病的监测和爆发调查。
评估内容：方案包括血清型/分组和基于分子分型的聚类分析，涵盖欧洲公共卫生相关的菌株，代表广泛的临床相关侵袭性李斯特菌类型。
参与情况：共有21个实验室参与，其中18个实验室完成了整个EQA方案，比EQA-9增加了1个实验室。大多数参与者（71%）完成了整个EQA方案，86%的参与者参与了血清型分析和聚类分析。
血清型分类：所有参与者正确地对所有七个测试菌株进行了血清型分类，平均正确率为100%。
分子分型聚类分析：分子分群的结果良好，正确率为95%。大多数参与者（94%）正确识别了七个紧密相关的菌株群，但存在一些错误，可能由于使用了较不具区分性的方法（如PFGE）或对边缘菌株的截止值设定不同。
质量控制：所有实验室都检测到混合序列类型的问题，94%的参与者识别出低覆盖率的质控问题。参与者对EQA提供的数据和菌株进行了有效的质量控制评估，包括评估覆盖范围、N50值、序列长度和contigs数量等参数。
趋势：从传统血清分型向分子血清分型的过渡趋势明显，分子血清分群已成为欧盟/欧洲经济区国家公共卫生实验室的最佳实践。
建议：建议实验室在使用EQA提供的数据和菌株验证其分析方法时，如果得到不正确的结果或实施新方法和程序时，应进行进一步调查。同时，建议ECDC和FWD-Net继续提升序列数据生成和分析的质量，并提供更多的培训和支持。