抗疟药物耐药性分子标记简编中使用的方法和阈值

分子标记物概述

简介

《抗疟药耐药性分子标记物汇编》旨在提供基于证据的、最新的资源，展示与抗疟药敏感性降低相关的基因突变。汇编通过实验室、临床和遗传流行病学三个领域的证据对分子标记物进行总结和分类，这些领域代表相互补充的证据链，支持特定基因突变与耐药性之间的关联。该方法基于早期的分类工作（包括对 PfKelch13 突变的分类），并设计为随着新证据的出现而发展。汇编将根据新证据的审查每年更新，并在适用的情况下对分子标记物和方法进行修订。

开发过程

汇编的开发过程包括以下步骤：

1. 制定预定义的标准和阈值，用于评估每个领域的证据质量。这些阈值由世界卫生组织召集的独立专家咨询制定，旨在平衡科学严谨性和不同证据来源和设计质量的实用性。
2. 文献综述。由主要审查员对发表的实验室、临床和遗传流行病学数据进行审查和评估。
3. 专家咨询。进行两轮专家审查，以完善和验证标记物分类，评估研究质量，并考虑影响解释的背景因素。

方法

所有基因标记物根据为每个证据领域（实验室、临床和遗传流行病学）制定的预定义阈值进行分类。在每个领域内，考虑不同类型的证据，以评估基因突变与抗疟药耐药性之间的因果关系。满足领域特定阈值的标记物将被考虑纳入汇编。根据跨领域的综合评估，每个基因突变被分类为潜在、候选或验证的抗疟药耐药性标记物。

阈值

实验室证据

评估实验室数据时考虑三种类型的证据：

1. 证实基因突变在体外降低寄生虫对药物的敏感性，使用转染菌株、野外分离株或实验室培养适应株，或遗传杂交产生的后代。
2. 使用野外分离株或实验室培养适应株进行体外活性研究（如果缺乏转染研究证据）。
3. 使用遗传杂交后代进行体外活性研究（如果缺乏转染研究证据）。

临床数据

评估临床数据时考虑三种类型的证据：

1. 患者中寄生虫清除延迟。
2. 治疗失败（复发）。
3. 治疗后获得性基因变异的选择证据。

遗传流行病学

考虑在药物压力下，赋予降低药物敏感性的基因突变可能获得选择性优势，导致其在人群中的流行率增加。评估遗传流行病学数据时仅考虑基因变异的流行率。

结论

汇编提供了一个综合且最新的知识来源，涵盖了与抗疟药耐药性相关的基因突变。通过明确的证据评估方法和分类框架，汇编为研究人员和决策者提供了可靠的工具，以监测和应对抗疟药耐药性的挑战。