2022年MRD动态监测技术细分研究报告

摘要摘要 MRD动态监测推动肿瘤诊疗 MRD动态监测推动肿瘤诊疗技术的迭代 技术的迭代—— MRD动态监测技术持续升级 MRD动态监测技术持续升级 Ø传统的血液肿瘤复发检测经历了形态学评估、流式细胞术以及分子生物学评估等方》传统的血液肿瘤复发检测经历了形态学评估、流式细胞术以及分子生物学评估等方》传统的血液肿瘤复发检测经历了形态学评估、流式细胞术以及分子生物学评估等方式，随着技术的发展，检测灵敏度虽然有所提升，但是在临床上依旧有各种限制因式，随着技术的发展，检测灵敏度虽然有所提升，但是在临床上依旧有各种限制因素导致难以广泛的应用。目前，对于血液肿瘤常用的MRD动态监测方法包括了实时定量聚合酶链式反应技术(RT-PCR)，多参数流式细胞术(MFC)和二代基因测序(NGS)技术。 MRDMRD动态监测的目的是在治疗期间或之后，或当患者处于动态监测的目的是在治疗期间或之后，或当患者处于 素导致难以广泛的应用。目前，对于血液肿瘤常用的MRD动态监测方法包括了实时 定量聚合酶链式反应技术(RT-PCR)，多参数流式细胞术(MFC)和二代基因测序(NGS) 缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶性细胞进行动态 缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶性细胞进行动态 技术。 为了降低实体瘤为了降低实体瘤MRD动态监测门槛目前主要存在两大技术路线以MRD动态监测门槛目前主要存在两大技术路线以提高检测灵敏度 的监测，实施疗效评估，治疗指导及复发预测，具有复发监 的监测，实施疗效评估，治疗指导及复发预测，具有复发监 提高检测灵敏度 Ø>Tumor-agnostic是使用预先选择的一组固定的热点肿瘤突变位点对cfDNA进行检测Tumor-agnostic是使用预先选择的一组固定的热点肿瘤突变位点对cfDNA进行检测，无需获取肿瘤组织。由于方法本身固有的局限性导致灵敏度较差，有时会辅以表观无需获取肿瘤组织。由于方法本身固有的局限性导致灵敏度较差，有时会辅以表观基因组学（甲基化位点和片段组学）对MRD进行监控。 测、复发风险评估、疗效监测、预后评估、治疗干预决策等 测、复发风险评估、疗效监测、预后评估、治疗干预决策等 基因组学（甲基化位点和片段组学）对MRD进行监控。 临床指导意义。 临床指导意义。 ØTumor-informed是基于原发肿瘤组织的变异信息，形成每个患者个性化的变异图谱并利用其进行并利用其进行MRD监控。虽然流程相对复杂，但是具有更高的灵敏度，更低的全流MRD监控。虽然流程相对复杂，但是具有更高的灵敏度，更低的全流程监控成本，是目前最准确和经济的检测路径。 >Tumor-informed是基于原发肿瘤组织的变异信息，形成每个患者个性化的变异图谱 MRDMRD最初是血液肿瘤领域的概念，已成为NCCN（Nationa最初是血液肿瘤领域的概念，已成为NCCN（National 程监控成本，是目前最准确和经济的检测路径。 Comprehensive Cancer NetworkComprehensiveCancerNetwork，美国国立综合癌症网络，美国国立综合癌症网络） MRD动态监测可以连续监测直至转移复发贯穿肿瘤精准诊疗的全过 MRD动态监测可以连续监测直至转移复发贯穿肿瘤精准诊疗的全过程程 临床标准实践的一部分。近年来，临床标准实践的一部分。近年来，MRD动态监测技术的进MRD动态监测技术的进 Ø 以至本医疗的产品至美OriMIRACLES™为例，临床试验前，能够对于受试者进行入组筛选，肿瘤治疗的过程中辅助诊断，适时的根据患者的病情调整疗法并进行疗效监测，并在治疗后定期对患者进行复发监测。同时，也通过对临床数据的整理与分 以至本医疗的产品至美OriMIRACLES"为例，临床试验前，能够对于受试者进行入 步，以及众多临床试验的推进，使其也被逐步引入到实体瘤 步，以及众多临床试验的推进，使其也被逐步引入到实体瘤 组筛选，肿瘤治疗的过程中辅助诊断，适时的根据患者的病情调整疗法并进行疗效 监测，并在治疗后定期对患者进行复发监测。同时，也通过对临床数据的整理与分析来反哺药物开发，为药物的研发流程提供坚实的数据基础。析来反哺药物开发，为药物的研发流程提供坚实的数据基础。 的研究中，如肺癌、结直肠癌、乳腺癌和前列腺癌等。 的研究中，如肺癌、结直肠癌、乳腺癌和前列腺癌等。 名词解释Terms 助治疗等根治性治疗之后，体内可能还存在少量肿瘤细胞，并释放微量肿瘤DNA进入血液。助治疗等根治性治疗之后，体内可能还存在少量肿瘤细胞，并释放微量肿瘤DNA进入血液。助治疗等根治性治疗之后，体内可能还存在少量肿瘤细胞，并释放微量肿瘤DNA进入血液。 u5年生存率：五年生存率系指某种肿瘤经过各种综合治疗后，生存五年以上的比例。用五年生存率表达有其一定的科学性。5年生存率：五年生存率系指某种肿瘤经过各种综合治疗后，生存五年以上的比例。用五年生存率表达有其一定的科学性。5年生存率：五年生存率系指某种肿瘤经过各种综合治疗后，生存五年以上的比例。用五年生存率表达有其一定的科学性。 Terms u流式细胞术：流式细胞技术（flow cytometry，FCM）是利用流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选技术。流式细胞术工作原理是在细胞分子水平上通过单克隆抗体对单个细胞或其他生物粒子进行多参数、快速的定量分析。它可以高速分析上万个细胞，并能同时从在细胞分子水平上通过单克隆抗体对单入细胞或其他生物粒子进行多参数、快速的定量分析。它可以高速分析上方入细胞，并能同时从一个细胞中测得多个参数，具有速度快、精度高、准确性好的优点，是当代最先进的细胞定量分析技术之一。 流式细胞术：流式细胞技术（flowcytometry，FCM）是利用流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选技术。流式细胞术工作原理是 一个细胞中测得多个参数，具有速度快、精度高、准确性好的优点，是当代最先进的细胞定量分析技术之一。 u融合基因RT-PCR法：PCR的特异性扩增肿瘤相关的融合基因。 融合基因RT-PCR法：PCR的特异性扩增肿瘤相关的融合基因。 uIgH/TCR重排定量PCR法：PCR的特异性扩增IgH/TCR重排。 +IgH/TCR重排定量PCR法：PCR的特异性扩增IgH/TCR重排。 uNGS技术：二代测序（NGS）是一种高通量测序方法，可以对DNA或RNA样本的碱基对进行快速测序。NGS支持广泛的应用，包括基→NGS技术：二代测序（NGS）是一种高通量测序方法，可以对DNA或RNA样本的碱基对进行快速测序。NGS支持广泛的应用，包括基→NGS技术：二代测序（NGS）是一种高通量测序方法，可以对DNA或RNA样本的碱基对进行快速测序。NGS支持广泛的应用，包括基因表达谱分析、染色体计数、表观遗传学变化检测及分子分析。因表达谱分析、染色体计数、表观遗传学变化检测及分子分析。 u肿瘤标志物panel：Panel是高通量测序技术（NGS）发展起来的一个词语，主要指同时检测多个基因、多个位点。多个基因可以是一个肿瘤标志物panel：Panel是高通量测序技术（NGS）发展起来的一个词语，主要指同时检测多个基因、多个位点。多个基因可以是一个Panel，数十个基因也可以是一个Panel，数百上千个基因也可以是一个Panel。 Panel，数十个基因也可以是一个Panel，数百上个基因也可以是一个Panel。 uWES：Whole Exome Sequencing，全外显⼦组测序技术，基因上包含蛋白质合成密码“指令”的区域被称作“外显子”(exon)，基因组中全部的外显子被统称为“外显子组”。WES (whole exome sequencing)全外显子组测序技术，是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕获富集后进行高通量测序。捕获富集后进行高通量测序。 +WES：WholeExomeSequencing，全外显子组测序技术，基因上包含蛋白质合成密码"指令"的区域被称作"外显子*(exon)基因组中全部 的外显子被统称为*外显子组"。WES(wholeexomesequencing)全外显子组测序技术，是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA uLoD：检测限（LOD, limit of detection）又称为检出限，是对低浓度的分析物样本进行测试，在一定的概率的条件下能测得的最低值。是方法（方法检测限MDL）和仪器（仪器检测限IDL）灵敏度体现的重要指标之一。 →LoD：检测限（LOD，limitofdetection）又称为检出限，是对低浓度的分析物样本进行测试，在一定的概率的条件下能测得的最低值。是 方法（方法检测限MDL）和仪器（仪器检测限IDL）灵敏度体现的重要指标之一。 uVAF值：VAF的全称是Variant Allele Frequency（变异等位基因频率）或Variant Allele Fraction（变异等位基因分数）。简单来说就是在基因组某个位点支持alternate/mutant allele的reads覆盖深度占这个位点总reads覆盖深度的比例。 VAF值：VAF的全称是VariantAlleleFrequency（变异等位基因频率）或VariantAlleleFraction（变异等位基因分数）。简单来说就是在基 因组某个位点支持alternate/mutantallele的reads覆盖深度占这个位点总reads覆盖深度的比例。 Chapter 1 Chapter 1 血液肿瘤MRD动态监测 血液肿瘤MRD动态监测 口MRD动态监测的目的是在治疗期间或之后，或当患q MRD动态监测的目的是在治疗期间或之后，或当患者处于缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶者处于缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶性细胞进行动态的监测性细胞进行动态的监测 口随着技术的选代，高精准度、高通量的NGS技术已q 随着技术的迭代，高精准度、高通量的NGS技术已经可以用来对众多肿瘤标志物panel进行高通量检测，在效率、准确性、灵敏度上均有优势 经可以用来对众多肿瘤标志物panel进行高通量检测，在效率、准确性、灵敏度上均有优势 66 ©2022 LeadLeo 血液肿瘤复发检测发展历程 血液肿瘤MRD动态监测 血液肿瘤MRD动态监测——血液肿瘤复发检测发展历程 VRD动态监测的自的是在治疗期间或之后，或当患者处十缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶性细胞进行动态的监测 MRD动态监测的目的是在治疗期间或之后，或当患者处于缓解期时，对存在于受试者体内的低水平恶性细胞进行动态的监测 传统的血液肿瘤复发检测 传统的血液肿瘤复发检测 血液肿瘤MRD动态监测 一血液肿瘤常用的MRD检测技术 血液肿瘤MRD动态监测——血液肿瘤常用的MRD检测技术 目前血液肿瘤常用的MRD检测技术包括融合基因RT-PCR法、流式细胞术、IgH/TCR重排定量PCR法和 目前血液肿瘤常用的MRD检测技术包括融合基因RT-PCR法、流式细胞术、IgH/TCR重排定量PCR法和NGS技术 NGS技术 目前血液肿瘤常用的目前血液肿瘤常用的MRD检测技术MRD检测技术 q MRD在血液系统肿瘤的应用主要集中在急性髓系白血病，急性淋巴细胞白血病，多发性骨髓瘤三种类型上。肿瘤病人治疗后体内残存的肿瘤细胞数量很少，且没有临床口MRD在血液系统肿瘤的应用主要集中在急性髓系白血病，急性淋巴细胞白血病，多发性骨髓瘤三种类型上。肿瘤病人治疗后体内残存的肿瘤细胞数量很少，且没有临床症状，所以不易察觉，但肿瘤的复发也往往源于此，因此识别出远低于细胞形态学CR阈值的残留病变，是提高风险分类与预后的关键要素。MRD是在分子水平上对疾症状，所以不易察觉，但肿瘤的复发也往往源于此，因此识别出远低于细胞形态学CR阔值的残留病变，是提高风险分类与预后的关键要素。MR