CircRNA产业化瓶颈突破
选择环状RNA的理由
环状RNA(circRNA)因其共价闭合环状结构,具有超越线性mRNA的稳定性,包括抗核酸外切酶降解的半衰期延长和降低先天免疫反应的特性。其优势使其成为新一代RNA技术,可用于长效蛋白表达、miRNA海绵或RNA适配体设计,并在体内CAR-T治疗领域取得突破性进展,展现出生产周期短、成本低、易于规模化生产的优势。
CircRNA面临的设计挑战
体外环化策略
- 酶法连接:经典方法,但连接效率受RNA二级结构影响,适用于短链RNA。
- 核酶剪接法:模拟天然自剪接机制,实现长链RNA高效环化,但易受目标序列干扰。
- ProBio解决方案:
- 有痕环化方案:引入底物增强序列提高环化率,ProBio通过序列优化缩短序列长度降低免疫原性。
- 定制化无痕方案:完全定制化设计,通过自由能计算与动态折叠模拟提升单轮成功率。
- 即插即用无痕方案:预筛选环化元件,实现高效无疤痕环化,支持并行构建不同IRES和密码子优化库。
CircRNA蛋白表达
- 挑战:CircRNA通过IRES启动翻译,IRES构象稳定性与编码区序列的干扰关系影响表达效率。
- ProBio解决方案:通过平衡IRES构象稳定性和编码区翻译延伸速率,系统性提升表达性能。
环状RNA生产与分析检测
- 挑战:环化效率调控、杂质去除(线性RNA前体、开环RNA、核酶片段)及纯化分析。
- ProBio解决方案:
- 工艺优化:精细调控环化反应条件,采用多维纯化策略(酶法或层析法)提高纯度。
- 质量控制:基于IPRP-HPLC、CGE-PA800及CGE-5200的多维度检测体系,确保高纯度、低免疫原性。
案例解析
CircRNA序列从头设计与工艺放大
- 设计流程:使用“即插即用”无痕环化方案,构建5个circRNA前体,环化效率>60%,纯度>85%。
- 蛋白表达:规模化生产的circRNA蛋白表达更高效,表达窗口更长。
CircRNA-anti-CD19-CAR分子功能验证
- 序列优化:NeoLNP™ SDR2008转染Jurkat细胞筛选,阳性率显著提升,持续表达效果更优。
- 蛋白表达评估:CircRNA-Anti-CD19-CAR半衰期显著长于线性mRNA,验证了circRNA结构稳定性优势。
核心优势总结
ProBio的CircRNA平台构建“三位一体”技术体系:
- 序列设计:即插即用环化策略与AI辅助预测模型,提升无痕环化率和筛选成功率。
- 工艺优化:高度整合的环化工艺,突破纯度瓶颈(终产物纯度>80%,总回收率>40%,nicked RNA<10%)。
- 质量控制:多维度检测体系(IPRP-HPLC、CGE-PA800及CGE-5200),精准识别关键杂质。
- 产业化能力:实现从实验室到GMP级生产跨越,功能验证显示持续表达72-96小时,蛋白产量提升,CMC成本可控,具备多项目批生产交付经验。