本研究观察了六种具有不同 MHC 单倍型的实验性近交鸡系中的盲肠微生物群组成与描述免疫反应的参数之间的相互作用。动物受到传染性支气管炎病毒 (IBV) 的攻击感染,其中一半之前接种过针对这种病原体的疫苗。结果表明,免疫接种和遗传系在 IBV 攻击感染后对微生物群的显着影响,接种疫苗的鸡的细菌丰富度较低。此外,不同品系之间以及接种疫苗和未接种疫苗的动物之间的不同盲肠群落分布也得到了观察。所有品系的疫苗接种效果相似,瘤胃球菌 UCG-014 和粪杆菌属的 OTU 丰度降低,丰度增加来自 Eisenbergiella 属的 OTU。此外,TCRΥδ T 细胞(由 TCR 判断Υδ 表达)可能是参与这种相互作用的重要组成部分,特别是与来自大肠杆菌-志贺氏菌属的细菌。我们假设来自 Escherichia-Shigella 属的细菌增加了细菌脂质抗原的全身水平,随后减轻了家禽 γδ T 细胞。