从 RNA-seq 临床活检中分离单核的优化方案

这篇科学报告研究了一种优化的协议，用于从临床活检中分离核用于 RNA-seq。该方法适用于小针活检，避免了细胞分选和超速离心，因此节省了时间。样品可以在90分钟或更短的时间内处理完毕。这种方法对于获得没有结构损伤迹象的正常细胞核形态是有效的。使用snRNA-seq，从正常和移植前急性肾损伤同种异体移植样本中回收了16个不同的肾细胞簇，包括免疫细胞簇。质量控制测量表明，这些优化消除了细胞碎片，并为文库制备和测序提供了高产量的高质量细胞核和RNA。