文献中同时出现的生物实体的层次网络分析

这篇科学报告探讨了如何使用ChexMix工具从PubMed数据库中提取生物实体，包括物种、化学物质和疾病，并构建具有相关物种的分类树。ChexMix能够提取与同一文献中的关键字同时出现的生物实体的医学主题词唯一标识符，并将其与物种、化学品和疾病等的唯一标识符进行转换和链接。通过分析这些生物实体之间的关联，可以构建二分或多分网络或分层树，有助于检查和理解与作为关键字查询的目标主题相关的信息的整体结构。